Diversité et structure génétique des populations de Parkia biglobosa (Jacq.) R. Br. de trois zones agro-écologiques du Sud Bénin

Abstract

Parkia biglobosa, est une espèce typique des parcs agroforestiers répandue dans la savane soudanienne. Elle présente de multiples fonctions et constitue une source inestimable de biens et de services pour les communautés locales en Afrique de l’Ouest. Une étude a été réalisée dans les zones agro-écologiques des terres de barre, de la dépression et des pêcheries, du Bénin et a eu pour but d’évaluer la diversité et la structure génétiques des populations de Parkia biglobosa de ces zones. Vingt-et-un accessions correspondantes à vingt-et-un placeaux, ont été collectées dans les trois zones. Respectivement, huit, six et sept individus de l’espèce en étude, ont été prélevés dans les zones agro-écologiques des terres de barre, de la dépression et des pêcheries. Au total, huit marqueurs microsatellites SSRs spécifiques à l’espèce Parkia biglobosa ont été testés. Les huit marqueurs utilisés sont polymorphes et ont révélé en tout, cinquante-huit allèles sur l’ensemble des morphotypes considérés. Le taux de polymorphisme est évalué donc à 100 %. Le nombre d’allèles varie de 5 à 14 selon les loci avec un nombre moyen de 7,25 allèles par marqueur. Les allèles rares (fréquence < 5 %) représentent 24,13 % de l’ensemble, soit 14 allèles rares sur les 58 allèles. La diversité génétique de Nei (ou hétérozygotie attendue) de l’ensemble de la collection est de 0,83 et varie de 0,72 (pour le locus PbL04) à 0,95 (pour le locus PbL09). La valeur moyenne par locus du taux d’hétérozygotie observée, est de 0,81. Ce taux par locus est inférieur à 1, pour tous les loci sauf, pour les loci PbL09 et PbL11 qui, ont un taux d’hétérozygotie observée, égal à 1. Seul le locus PbL21, a un taux d’hétérozygotie inférieur à 0,50. Concernant l’écart à la panmixie (F), F > 0 (positif) pour deux des huit loci. Il s’agit des loci spécifiques PbL21 et PbL22. Par déduction, les populations présentant de tels indices, connaissent un déficit en hétérozygotes par rapport à l'équilibre panmictique. F < 0 (négatif) dans le cas des six autres loci. Donc, les populations ici ne présentent pas un déficit mais plutôt un excès, en hétérozygotes par rapport à l'équilibre panmictique. Par ailleurs, le dendrogramme réalisé révèle que les 21 accessions de Parkia biglobosa, sont organisées en trois groupes comportant respectivement 17, 2 et 2 individus. D’où l’existence d’une diversité intra et inter populations des morphotypes de Parkia biglobosa des zones agro-écologiques, en étude. Ces résultats ont le mérite de fournir des détails très utiles, pour la conservation de cette espèce, en voie de disparition, malgré les multiples biens et services, qu’elle rend.